La fondation du RC Avusy a eu lieu en 1989 par cinq amis qui souhaitaient créer un nouveau club dans la partie rurale ouest du canton de Genève.

Le club a disputé ses premiers matchs sur la place d’armes d’Epeisses avant que les membres n’aménagent peu après leur propre terrain à Athenaz.

Avusy a commencé en Ligue nationale C et est monté en Ligue nationale B après deux ans.

En 1993, le club a remporté le titre de champion de deuxième division, ce qui lui a permis d’accéder pour la première fois à la Ligue nationale A.

Après une nouvelle saison en Ligue nationale B, le club est remonté en 1996 puis en 2000.

Au cours du nouveau millénaire, le club a réussi à s’établir durablement dans la plus haute division.